南宁大学于1958年8月16日创办，校址分2处，校本部设于今南宁市明秀东路广西师院址，9月招生开学。南宁大学分工学院、师范学院、医学院(在本部)和农学院(在西乡塘，今广西农校址)。工学院设立机械、化学、冶金3个系，招生150人，学制3年；师院设立语文、数学2个专业，招生80人，学制2年；医学院设立中医、西医、五官等科系，招收新生150人，学制3年；农学院设立农作、园艺、畜牧兽医3个系，招生150人，学制3年。学校贯彻勤俭办学、半工半读、教育与生产劳动相结合、边做边学、理论与实际相结合、政治与技术相结合的办学方针。

1959年7月，南宁大学下马。原属医学院改为南宁医学专科学校；师范学院改为南宁师范专科学校；农学院改为南宁中等农业学校；工学院停办。

1962年，南宁师专分科分别并入广西民族学院和桂林广西师范学院(今广西师范大学)；南宁医学专科学校于1971年并入广西中医学院。