吉大最值得就读的特色专业有车辆工程、法学、化学、临床医学、机械工程及其自动化、护理学、计算机科学与技术等。

吉大王牌优势专业有很多，比如车辆工程、法学、化学、临床医学、资源勘查工程、植物保护、放射医学、朝鲜语、新闻学等。

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在教育部全国第四轮学科评估结果中，吉林大学马克思主义理论、化学评估结果为A，哲学、法学、政治学、考古学、数学、物理学、机械工程、计算机科学与技术、工商管理评估结果为A-，这些学科下设专业大多是吉大非常好的专业。