PCR技术中选择50摄氏度是因为这个温度可以使得DNA引物松开与模板DNA的结合，从而达到引物的特异性结合。此外，50摄氏度可以激活Taq聚合酶，加速PCR扩增反应的进程。

同时，50℃是合适的温度，既能够使DNA引物准确结合，又不会导致过度结合引物，从而避免引物结合模板DNA的副产物形成，因此成为PCR技术中引物的理想温度。

pcr选择50℃作为退火温度的参考温度是因为一般引物tm值大概位于48～55℃，但是这仅仅是参考值，退火温度一般为引物最低tm值减2，或平均tm值减4，而且要获得最好结果一般需要进行优化。