缴纳耕地占用税的会计分录如下：

1、企业发生耕地占用税时，通过“在建工程”科目核算，借：在建工程， 贷：应交税费-应交耕地占用税。

2、企业缴纳耕地占用税时，借：应交税费-应交耕地占用税， 贷：银行存款。