专项资金上缴回财政的账务处理如下：企业实际收到专项资金时，应做以下账务处理：借：银行存款， 贷：专项应付款。当项目完成，形成各项资产的部分，按实际成本做以下分录：借：固定资产（或其它相关科目）， 贷：有关科目。同时，借：专项应付款， 贷：资本公积——拨款转入。未形成资产需核销的部分，经批准后，借：专项应付款， 贷：有关科目。最后，拨款结余上交时，借：专项应付款， 贷：银行存款。以上内容仅供参考，具体账务处理还需根据实际情况进行调整。