1、入学方式不同

在职研究生：有同等学力申硕、中外合作办学硕士、国际硕士四种类型。其中同等学力申硕和国际硕士是免试入学，中外合作办学硕士是免联考，只需参加院校考试即可。

非全日制研究生：考试入学，依次通过全国联考和院校复试者，获得入学资格。

2、报名条件不同

在职研究生：同等学力申硕课程班是大专及以上学历，具备本科学士学位满3年可以申硕;国际硕士、中外合作办学硕士是院校自主招生，一般大专及以上学历即可报名。

非全日制研究生：非管理类专业需要有大专学历满2年或者本科及以上学历;管理类专业需要有大专学历工作满5年及以上、或者本科学历工作满3年及以上、或者已有其他硕士/博士学位工作满2年及以上。

3、上课方式不同

在职研究生：上课方式有周末班、集中班和网络班三种，上课时间分别是周六日，节假日或寒暑假，自行安排。

非全日制研究生：上课方式是周末班和集中班，都是面授方式。

4、证书不同

在职研究生：以同等学力申硕方式报读的人员，可以获得的证书是结业证书和硕士学位证书;以中外合作办学硕士、国际硕士方式攻读的人员，在顺利毕业后，获得国外院校授予的硕士学位证书。

非全日制研究生：完成全部课程学习，顺利毕业后，获得硕士学位证书和硕士学历证书。