北京协和医院不免学费。

临床医学专业的学费为每生每学年5000元；护理学专业的学费为每生每学年4800元。学生在不同的学习阶段，由学校统一安排住宿，根据宿舍类型不同，收费标准不一。普通学生宿舍住宿费为临床医学每生每学年750元；护理学每生每学年900元。收费标准如有变动以北京市批复为准。

学校为鼓励学生德智体全面发展，设有多项奖学金，而且获奖面较宽。学习成绩优秀而家庭经济困难的学生除可获得各项奖学金外，还可申请国家设立的助学贷款，也可申请临时困难补助，学校还有减免学费的助学措施。