默纳克3000主板上的三个按键分别为电源键、重启键和BIOS设置键。电源键用于打开或关闭电脑，重启键用于重新启动电脑，BIOS设置键用于进入主板的BIOS设置界面进行调整和配置。

在调试中，可以通过按下电源键和重启键来测试电脑的开关机功能，而按下BIOS设置键则可以进入BIOS界面进行调试和配置各项参数，以确保电脑的正常运行和性能优化。