从内容上看，句式杂糅是病句的类型，藕断丝连是一个成语，比喻没有彻底断绝关系，这二者没有任何关联性，也谈不上什么区别。

从结构上看，句式杂糅，属于主谓式短语：句式（主）十杂糅；藕断丝连，属于主谓并列式短语：（藕断—主谓）十（丝连一主谓），两者属于不同类型的短语结构。

句式杂糅是病句的一种类型，指两种不同句式（结构）杂糅在一个句子中，造成表意不明。藕断丝连这一成语比喻事物间的内外联系紧密相连。