六合中等专业学校3+3专业有:机电技术应用、电子技术应用、数控技术应用、计算机技术应用、建筑经济管理、化工、旅游服务管理、电子商务、市场营销、工艺美术、动漫设计、农业机械化、农村经济管理等13个专业。机电技术应用和电子技术应用为省级示范专业，计算机技术应用为市级示范专业。

六合中等专业学校3+3专业有电子技术应用、高星级饭店运营与管理、计算机网络技术、会计事务、休闲农业生产与经营、机电技术应用六个专业,即三年在南京六合中等专业学校学习,三年后转段进入合作对接的高等职业学校就读,共六个班295人。