陕西轨道交通集团的组织架构是分层次管理的多级法人治理结构。原因是为了实现职权分明、事权统一和任务分工协调，有效提高工作效率和决策水平。具体来说，陕西轨道交通集团设有总经理办公室、营运管理部、工务管理部、财务管理部、安全管理部、物资管理部、人力资源部等多个职能部门，以及陕西省轨道交通股份有限公司、陕西省轨道交通集团电力有限公司、陕西交通建设投资有限公司等多个子公司。这些部门和子公司形成了一个完整的组织架构，实现了资产、经营、管理、人力等不同方面的统一管理。